近年来，云南省深入扎实开展土壤和地下水污染防治，土壤污染源头防控、农用地分类管理、建设用地准入管理取得积极进展，土壤环境质量总体保持稳定。地下水污染防治稳步推进，初步构建起地下水环境监测网络，地下水环境质量国考点位水质总体保持稳定，地下水生态环境安全得到有效保障。
土壤污染状况详查是一项重要的国情调查，对指导做好土壤污染防治具有重要的基础支撑作用。云南省及时总结详查成果，有效应用成果精准指导各地开展土壤污染源头防控、农用地分类管理和建设用地准入管理。编制《云南省土壤环境质量数据采集技术标准》《云南省土壤环境质量数据库标准》等地方标准，加强土壤环境质量数据管理和土壤重金属环境背景值在土壤污染风险评估中的应用。通过持续推进耕地周边涉镉等重金属重点行业企业排查整治，加强土壤污染重点监管单位环境监管，强化对土壤污染源头的防控。
为加快推进对耕地土壤污染成因排查和分析试点工作，云南省选择省内耕地污染典型地区，开展耕地土壤污染成因排查和分析试点项目，通过分析耕地周边的污染特征和状况，调查和评估土壤高背景值、工业企业污染源、农业面源污染等因素对耕地土壤的影响、范围、程度，探索耕地土壤污染成因排查、分析的方法与技术规范。截至目前，该项工作已取得阶段性成果，为下一步有针对性地开展耕地土壤污染防控提供了科学依据。与此同时，全省受污染耕地安全利用成效不断巩固提升，受污染耕地安全利用率由81.2%提升至90%。
全省强化部门信息共享和联动监管，有效保障重点建设用地安全利用。省生态环境厅、省自然资源厅联合印发《关于进一步加强建设用地再开发利用土壤环境联动监管的通知》，明确联动监管范围，细化管理要求，实现疑似污染地块、污染地块空间信息与国土空间规划“一张图”管理，依法落实建设用地土壤污染风险管控和修复名录制度。建立全省土壤污染状况调查、风险评估和效果评估报告审查管理体系，强化调查报告质量监督管理。
地下水污染防治方面，云南省编制完成《云南省地下水污染防治分区划分》，推进全省地下水污染源分区监管。持续推进地下水环境状况调查评估，整合生态环境、自然资源和水利部门地下水环境状况调查、水文地质勘查等信息，初步建立地下水环境信息数据库管理平台，推进地下水环境“一张图”管理。强化地下水环境质量目标管理。目前，全省44个地下水国考区域点位V类水比例控制在4.5%，6个地下水国考饮用水源点位水质达标率为100%，24个地下水国考污染风险监控点位水质基本保持稳定。
据悉，云南省将持续加强土壤污染源头防治。推进实施耕地土壤污染途径识别和污染源头追溯，提高精准控源和受污染耕地安全利用水平;深入推进农用地分类管理，巩固提升受污染耕地安全利用率;深化部门信息共享和联动监管机制，严格建设用地准入管理;稳步推进地下水环境风险管控，完善地下水环境质量监测网络，实施土壤和地下水环境风险协同防控
